Tại đầu bến Hồ Chí Minh, cảng khai thác tàu khách là cảng Sài Gòn - Hiệp Phước (Huyện Nhà Bè). Tuy nhiên do cảng Sài Gòn - Hiệp Phước cách trung tâm Tp.HCM hơn 20km nên để tạo thuận tiện cho hành khách Tàu Greenlines DP sẽ trung chuyển khách từ Bến Bạch Đằng (Quận1) ra cảng Sài Gòn - Hiệp Phước với thời gian 50 phút. Tại đây hành khách sẽ được lên tàu do công ty Phú Quốc Express vận hành để tiếp tục đi Côn Đảo với thời gian di chuyển 6 tiếng. Công Ty Cổ Phần Tàu Cao Tốc Phú Quốc, sử dụng cho hành trình Sài Gòn - Côn Đảo là Tàu Thăng Long với vận tốc 30 hải lý/1 giờ. Đây là con tàu 1 thân lớn nhất Việt Nam, bao gồm 4 tầng, trong đó 2 tầng dành cho khoang Eco, 1 tầng dành cho khoang Vip, và tầng còn lại bố trí cho không gian dành cho các hoạt động cafe và thư giãn, tổng sức chứa lên đến 1017 khách.
